Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126 ms