Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms