Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdca3Q99M54 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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