Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms