Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RtcbQ99LF4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms