Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms