Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ctu1Q99J10 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ctu1Q99J10 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ctu1Q99J10 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ctu1Q99J10 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ctu1Q99J10 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ctu1Q99J10 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ctu1Q99J10 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ctu1Q99J10 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ctu1Q99J10 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ctu1Q99J10 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ctu1Q99J10 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ctu1Q99J10 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ctu1Q99J10 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ctu1Q99J10 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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