Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NelfcdQ922L6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfcdQ922L6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms