Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Pde6cQ91ZQ1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Pde6cQ91ZQ1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Pde6cQ91ZQ1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Pde6cQ91ZQ1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Pde6cQ91ZQ1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Pde6cQ91ZQ1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pde6cQ91ZQ1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pde6cQ91ZQ1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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