Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms