Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apol9aQ8VDU3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms