Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ttc8Q8VD72 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ttc8Q8VD72 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ttc8Q8VD72 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ttc8Q8VD72 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ttc8Q8VD72 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ttc8Q8VD72 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ttc8Q8VD72 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ttc8Q8VD72 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Ttc8Q8VD72 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Ttc8Q8VD72 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Ttc8Q8VD72 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Ttc8Q8VD72 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Ttc8Q8VD72 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc8Q8VD72 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms