Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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