Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Sgms1Q8VCQ6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms