Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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