Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Dnajc28Q8VCE1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnajc28Q8VCE1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnajc28Q8VCE1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnajc28Q8VCE1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnajc28Q8VCE1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Dnajc28Q8VCE1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnajc28Q8VCE1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Dnajc28Q8VCE1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnajc28Q8VCE1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnajc28Q8VCE1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Dnajc28Q8VCE1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnajc28Q8VCE1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnajc28Q8VCE1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnajc28Q8VCE1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnajc28Q8VCE1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnajc28Q8VCE1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnajc28Q8VCE1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Dnajc28Q8VCE1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Dnajc28Q8VCE1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Dnajc28Q8VCE1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Dnajc28Q8VCE1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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