Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms