Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rassf9Q8K342 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf9Q8K342 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf9Q8K342 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf9Q8K342 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf9Q8K342 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf9Q8K342 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf9Q8K342 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf9Q8K342 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf9Q8K342 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms