Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms