Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms