Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
1700001C19RikQ8K168 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms