Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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FgbQ8K0E8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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FgbQ8K0E8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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FgbQ8K0E8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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FgbQ8K0E8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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FgbQ8K0E8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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FgbQ8K0E8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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FgbQ8K0E8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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FgbQ8K0E8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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