Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pnma3Q8JZW8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnma3Q8JZW8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms