Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Znf628Q8CJ78 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Znf628Q8CJ78 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Znf628Q8CJ78 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Znf628Q8CJ78 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Znf628Q8CJ78 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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