Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TwnkQ8CIW5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwnkQ8CIW5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms