Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Clip4Q8CI96 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Clip4Q8CI96 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Clip4Q8CI96 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Clip4Q8CI96 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Clip4Q8CI96 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Clip4Q8CI96 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Clip4Q8CI96 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Clip4Q8CI96 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Clip4Q8CI96 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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