Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms