Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClasrpQ8CFC7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms