Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc17Q8CE13 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc17Q8CE13 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc17Q8CE13 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Ccdc17Q8CE13 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Ccdc17Q8CE13 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc17Q8CE13 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc17Q8CE13 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc17Q8CE13 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc17Q8CE13 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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