Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms