Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms