Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spef2Q8C9J3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spef2Q8C9J3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms