Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ppfibp1Q8C8U0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms