Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7E7

Stbd1, Starch-binding domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stbd1Q8C7E7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Stbd1Q8C7E7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Stbd1Q8C7E7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Stbd1Q8C7E7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stbd1Q8C7E7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms