Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nlrp4bQ8C6J9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nlrp4bQ8C6J9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nlrp4bQ8C6J9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nlrp4bQ8C6J9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nlrp4bQ8C6J9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nlrp4bQ8C6J9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nlrp4bQ8C6J9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms