Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C5C9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms