Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms