Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms