Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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