Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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