Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms