Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Usp38Q8BW70 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Usp38Q8BW70 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp38Q8BW70 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp38Q8BW70 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp38Q8BW70 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp38Q8BW70 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp38Q8BW70 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp38Q8BW70 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp38Q8BW70 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp38Q8BW70 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp38Q8BW70 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp38Q8BW70 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp38Q8BW70 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp38Q8BW70 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp38Q8BW70 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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