Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms