Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cxcl16Q8BSU2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl16Q8BSU2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms