Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK06

Fbxo9, F-box only protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo9Q8BK06 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo9Q8BK06 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo9Q8BK06 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo9Q8BK06 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo9Q8BK06 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo9Q8BK06 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo9Q8BK06 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo9Q8BK06 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo9Q8BK06 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo9Q8BK06 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo9Q8BK06 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo9Q8BK06 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo9Q8BK06 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms