Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms