Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms