Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms