Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Htatsf1Q8BGC0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Htatsf1Q8BGC0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Htatsf1Q8BGC0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Htatsf1Q8BGC0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Htatsf1Q8BGC0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms