Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU8

Slc17a8, Vesicular glutamate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a8Q8BFU8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms